30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0261 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  65.91 
 
 
274 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  57.46 
 
 
272 aa  313  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  56.44 
 
 
277 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  54.73 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  47.93 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  45 
 
 
255 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  34.41 
 
 
285 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  35.27 
 
 
251 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  29.47 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  28.85 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  25.68 
 
 
399 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  39.53 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  39.29 
 
 
341 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  26.78 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  26.78 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  46.15 
 
 
346 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  27.96 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  44 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  25.84 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  29.17 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  28.21 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  27.75 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  41.07 
 
 
331 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  25.48 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  48 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  26.7 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  24.62 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  25.74 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4391  hypothetical protein  35.71 
 
 
78 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>