16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4888 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  46.25 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  45 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  44.26 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  42.92 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  43.33 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  43.61 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  35.25 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  32.46 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  30.48 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  28.72 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  32.75 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  30.69 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  29.79 
 
 		 330 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  29.79 
 
 		 330 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>