30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1149 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1149  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  564  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  59.02 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  57.46 
 
 
271 aa  313  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3349  hypothetical protein  54.74 
 
 
274 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  54.69 
 
 
256 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  50.82 
 
 
291 aa  235  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4888  hypothetical protein  44.26 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.608714  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  33.92 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  31.12 
 
 
251 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  24.65 
 
 
267 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  24.04 
 
 
399 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  26.21 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2937  hypothetical protein  27.14 
 
 
269 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283866  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  26.7 
 
 
306 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  24.88 
 
 
246 aa  48.9  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  43.64 
 
 
346 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  27.15 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  27.72 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  28.31 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  23.46 
 
 
316 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0116  hypothetical protein  26.63 
 
 
365 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3801  hypothetical protein  28.42 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0441026  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  26.24 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  44.44 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  26.24 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  29.45 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0782  hypothetical protein  26.13 
 
 
365 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  27.27 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  39.58 
 
 
341 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  40.38 
 
 
331 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>