36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2176 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  94.75 
 
 		 306 aa  577  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  86.27 
 
 		 306 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  89.22 
 
 		 284 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  51.32 
 
 		 330 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  51.32 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  51.32 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  50.85 
 
 		 307 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  51.01 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  79.29 
 
 		 304 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  49.66 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  48.2 
 
 		 316 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  41.95 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  44.72 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  44.8 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  44.56 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  44.25 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  38.36 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  43.42 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  36.9 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  36.55 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  39.22 
 
 		 315 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  38.16 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  44.37 
 
 		 199 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  62.3 
 
 		 65 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  31.09 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  32.92 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  26.42 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  28.09 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  25.64 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  60.98 
 
 		 84 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  27.07 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3801  hypothetical protein  27.23 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0441026  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0715  hypothetical protein  26.37 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2735  hypothetical protein  27.41 
 
 		 147 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  27.96 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>