26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25120 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  617  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  83.54 
 
 
306 aa  295  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33570  hypothetical protein  94.63 
 
 
151 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17160  hypothetical conserved  100 
 
 
141 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  79.29 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  72.83 
 
 
284 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  77.06 
 
 
306 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  51.55 
 
 
330 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  50.93 
 
 
330 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  50.93 
 
 
330 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  50.61 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  50.31 
 
 
304 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  48.8 
 
 
306 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  46.71 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  45.75 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  41.26 
 
 
307 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  39.64 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  45.1 
 
 
310 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  39.24 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  44.12 
 
 
304 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  43.38 
 
 
305 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  39.86 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  39.16 
 
 
311 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  38.1 
 
 
315 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  38.24 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  31.09 
 
 
146 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>