30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0439 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  62.63 
 
 
307 aa  358  8e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  58.88 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  54.46 
 
 
307 aa  323  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  50.51 
 
 
304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  48.17 
 
 
311 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  48.17 
 
 
311 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  44.41 
 
 
308 aa  257  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  45.7 
 
 
315 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  44.82 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  47.4 
 
 
318 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  44.26 
 
 
304 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  67.95 
 
 
199 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  39.86 
 
 
330 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  39.86 
 
 
330 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  42.14 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  43.42 
 
 
306 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  43.06 
 
 
306 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  38.59 
 
 
307 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  38.26 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  41.43 
 
 
284 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  43.38 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  38.81 
 
 
146 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  32.53 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  78.95 
 
 
84 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  70.73 
 
 
65 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  33.76 
 
 
312 aa  55.8  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  26.19 
 
 
399 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>