30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3364 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  85.08 
 
 		 318 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  48.57 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  45.67 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  41 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  44.64 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  40.89 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  40.89 
 
 		 311 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  42.65 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  45.7 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  44.37 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  42.24 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  35.02 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  39.22 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  36.63 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  38.52 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  38.16 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  38.13 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  36.52 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  35.62 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  45.95 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  38.1 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  32.08 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  27.8 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  56.1 
 
 		 65 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  57.5 
 
 		 84 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  23.18 
 
 		 399 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>