34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2871 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  86.27 
 
 		 306 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  85.57 
 
 		 306 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  80.07 
 
 		 284 aa  501  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  50.66 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  83.54 
 
 		 304 aa  295  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  49.5 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  50.17 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  48.83 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  43.86 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  44.72 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  43.11 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  44.09 
 
 		 304 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  40.13 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  37.7 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  36.27 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  35.95 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  42.14 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  38.87 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  38.52 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  43.71 
 
 		 199 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  31.11 
 
 		 146 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  29.8 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  27.42 
 
 		 312 aa  67  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  55.74 
 
 		 65 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  29.89 
 
 		 250 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3801  hypothetical protein  27.48 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0441026  normal  0.572466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2735  hypothetical protein  25.19 
 
 		 147 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342457 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0068  hypothetical protein  23.17 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0514  hypothetical protein  26.4 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.583693  normal  0.38508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>