24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1141 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  95.1 
 
 
311 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  94.41 
 
 
311 aa  284  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  40.68 
 
 
307 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  36.22 
 
 
305 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  38.81 
 
 
304 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  38.93 
 
 
308 aa  96.3  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  39.13 
 
 
307 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  37.59 
 
 
307 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  38.81 
 
 
305 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  40.16 
 
 
316 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  35.94 
 
 
304 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  37.07 
 
 
310 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  37.8 
 
 
306 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  36.84 
 
 
330 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  35.96 
 
 
330 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  35.96 
 
 
330 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  31.11 
 
 
306 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  33.06 
 
 
306 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  31.09 
 
 
304 aa  68.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  31.09 
 
 
306 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  32.14 
 
 
315 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  29.41 
 
 
284 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  32.2 
 
 
318 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>