31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1880 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  99.04 
 
 		 311 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  50.16 
 
 		 304 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  94.41 
 
 		 146 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  46.42 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  46.55 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  45.7 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  47.18 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  47.74 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  48.01 
 
 		 305 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  40.21 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  40.89 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  41.48 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  42.43 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  41.33 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  39.67 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  37.29 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  37.67 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  37.67 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  35.95 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  37.33 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  36.55 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  34.6 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  46.54 
 
 		 199 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  39.86 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  27.12 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  32.03 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  71.05 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  63.41 
 
 		 65 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  28.39 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0261  hypothetical protein  26.78 
 
 		 271 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>