27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0570 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  62.18 
 
 
307 aa  191  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  67.95 
 
 
305 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  60.65 
 
 
310 aa  184  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  58.11 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  55.48 
 
 
307 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  52.7 
 
 
304 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  43.58 
 
 
308 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  46.54 
 
 
311 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  46.54 
 
 
311 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  45.95 
 
 
315 aa  121  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  45.95 
 
 
318 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  44.37 
 
 
306 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  44.37 
 
 
306 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  43.71 
 
 
306 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  46.83 
 
 
284 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  39.35 
 
 
306 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  40.26 
 
 
304 aa  84.7  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  35.26 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  35.06 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  33.77 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  33.77 
 
 
330 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  37.7 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  64.86 
 
 
84 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  50.94 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  59.52 
 
 
65 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  58.06 
 
 
312 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>