15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1303 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  0.000000000778686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2844  hypothetical protein  50.65 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000126793  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  43.69 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  45.19 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0300  hypothetical protein  33.45 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  30.99 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2177  Domain of unknown function DUF1814  27.17 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000211086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  25.13 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4191  hypothetical protein  23.57 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0915772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1224  hypothetical protein  24.78 
 
 		 285 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3355  hypothetical protein  21.99 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0961  hypothetical protein  57.89 
 
 		 109 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000301997  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4234  hypothetical protein  29.3 
 
 		 241 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  36.62 
 
 		 355 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1879  hypothetical protein  24.66 
 
 		 246 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.671388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>