23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1610 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1368  hypothetical protein  36.97 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4191  hypothetical protein  34.43 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0915772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0849  hypothetical protein  34.43 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0937749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0812  hypothetical protein  34.04 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.113076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1224  hypothetical protein  32.45 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0713  hypothetical protein  32 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.144173 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0961  hypothetical protein  36.59 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000301997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1755  hypothetical protein  31.31 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  25.4 
 
 		 328 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  25.13 
 
 		 322 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  0.000000000778686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  24.6 
 
 		 305 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2177  Domain of unknown function DUF1814  29.19 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000211086  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0300  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  30.98 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  45.45 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2844  hypothetical protein  51.11 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000126793  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0970  hypothetical protein  29.05 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4908  Domain of unknown function DUF1814  29.24 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4515  hypothetical protein  26.16 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0827  hypothetical protein  41.54 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0228  hypothetical protein  38.57 
 
 		 97 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.939073  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3401  hypothetical protein  39.66 
 
 		 136 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>