20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4191 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4191  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0915772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0849  hypothetical protein  53.19 
 
 		 275 aa  299  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0937749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1368  hypothetical protein  47.55 
 
 		 290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0713  hypothetical protein  52.79 
 
 		 240 aa  261  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.144173 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0812  hypothetical protein  44.21 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.113076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1224  hypothetical protein  34.51 
 
 		 285 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0961  hypothetical protein  61.05 
 
 		 109 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000301997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  34.43 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3401  hypothetical protein  45.37 
 
 		 136 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1760  hypothetical protein  61.73 
 
 		 78 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566849 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1755  hypothetical protein  30.73 
 
 		 196 aa  86.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0228  hypothetical protein  44.57 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.939073  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2177  Domain of unknown function DUF1814  30.88 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000211086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2844  hypothetical protein  25.96 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000126793  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0300  hypothetical protein  23.94 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  23.83 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  23.85 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  23.44 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  23.57 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  0.000000000778686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0827  hypothetical protein  26.29 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>