17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0300 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0300  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3205  hypothetical protein  71.53 
 
 
296 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42811  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0953  hypothetical protein  33.22 
 
 
305 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  33.45 
 
 
322 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  0.000000000778686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2844  hypothetical protein  33.45 
 
 
337 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000126793  normal  0.912153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0846  hypothetical protein  35.18 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.22305  normal 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2177  Domain of unknown function DUF1814  26 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000211086  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4997  hypothetical protein  28.02 
 
 
247 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4191  hypothetical protein  23.94 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0915772  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0827  hypothetical protein  25.14 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0849  hypothetical protein  25.88 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0937749  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1368  hypothetical protein  23.23 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  27.08 
 
 
399 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3355  hypothetical protein  23.53 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1610  hypothetical protein  50 
 
 
234 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0812  hypothetical protein  25.84 
 
 
292 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.113076  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0961  hypothetical protein  44.44 
 
 
109 aa  43.1  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000301997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>