15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5958 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5958    100 
 
 		 216 bp  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00874292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  90 
 
 		 366 bp  60  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3500  ISPpu14, transposase Orf2  89.8 
 
 		 336 bp  58  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3965  ISPpu14, transposase Orf2  89.8 
 
 		 336 bp  58  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3980  ISPpu14, transposase Orf2  89.8 
 
 		 336 bp  58  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4438  ISPpu14, transposase Orf2  89.8 
 
 		 336 bp  58  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59570  putative transposase  89.8 
 
 		 336 bp  58  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207074  hitchhiker  4.45404e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0038  IS66 Orf2 family protein  89.8 
 
 		 336 bp  58  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1021  IS66 Orf2 family protein  89.8 
 
 		 333 bp  58  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1191  IS66 Orf2 family protein  89.8 
 
 		 333 bp  58  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1402  IS66 Orf2 family protein  89.8 
 
 		 333 bp  58  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2522  IS66 Orf2 family protein  89.8 
 
 		 333 bp  58  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175963  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4442  ISPpu14, transposase Orf2  87.76 
 
 		 336 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5397  ISPpu14, transposase Orf2  87.76 
 
 		 336 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  hitchhiker  0.00237418 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  100 
 
 		 378 bp  50.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>