More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3500 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3500  ISPpu14, transposase Orf2  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3965  ISPpu14, transposase Orf2  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3980  ISPpu14, transposase Orf2  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0641444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4438  ISPpu14, transposase Orf2  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000480323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59570  putative transposase  98.2 
 
 		 111 aa  225  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207074  hitchhiker  4.45404e-19 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0038  IS66 Orf2 family protein  99.1 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4442  ISPpu14, transposase Orf2  98.2 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5397  ISPpu14, transposase Orf2  98.2 
 
 		 111 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  hitchhiker  0.00237418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5174  IS66 Orf2 family protein  92.79 
 
 		 111 aa  214  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0746  IS66 Orf2 like  88.29 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4022  IS66 Orf2 family protein  72.07 
 
 		 111 aa  169  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1402  IS66 Orf2 family protein  75 
 
 		 110 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1172  IS66 Orf2 like  70.27 
 
 		 111 aa  168  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.768897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3060  IS66 Orf2 like  70.27 
 
 		 111 aa  168  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1021  IS66 Orf2 family protein  75 
 
 		 110 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2522  IS66 Orf2 family protein  75 
 
 		 110 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1191  IS66 Orf2 family protein  75 
 
 		 110 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2710  IS66 Orf2 like  70.27 
 
 		 111 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0711  IS66 Orf2 family protein  72.07 
 
 		 110 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5983  IS66 Orf2 family protein  71.17 
 
 		 110 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6938  IS66 Orf2 family protein  69.3 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417  IS66 family transposase  68.42 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221323  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1866  transposase, Orf2 like  68.42 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733675  normal  0.340479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3793  putative transposase  67.54 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0571  IS66 Orf2 family protein  70.87 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.915168  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2456  IS66 Orf2 family protein  70.87 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.718541  normal  0.912363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2917  IS66 Orf2 family protein  70.87 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1169  IS66 Orf2 family protein  62.16 
 
 		 111 aa  146  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.730957  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0423  IS66 Orf2 family protein  71.58 
 
 		 95 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4448  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.657267  normal  0.0820923 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4706  IS66 Orf2 family protein  58.41 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343016  normal  0.106133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2976  IS66 Orf2 family protein  59.38 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2668  IS66 Orf2 family protein  59.38 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.89024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1486  IS66 Orf2 family protein  59.38 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214509 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3323  IS66 Orf2 family protein  59.38 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0834  IS66 Orf2 family protein  59.38 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.323276 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1481  IS66 Orf2 family protein  43.97 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160906 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1089  IS66 Orf2 family protein  43.97 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1058  IS66 Orf2 family protein  43.97 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.66521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1365  IS66 Orf2 family protein  43.97 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579421 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4708  IS66 Orf2 family protein  55.1 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123105  normal  0.103462 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  48.42 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  48.42 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  48.42 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  48.42 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  48.42 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  48.42 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  48.42 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  45.26 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  44.33 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  44.33 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  44.33 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2256  IS66 Orf2 family protein  39.05 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.286379  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  41 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  43.3 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  38.54 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  36.73 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  35.71 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  35.71 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  38 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  35.71 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  36.73 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  38.46 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7465  IS66 Orf2 family protein  38.24 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  37.14 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  37.14 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  37.76 
 
 		 117 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  37.14 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  36 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0079  hypothetical protein  37.25 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2549  putative IS66 transposase, TnpB  37.25 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3737  putative transposase  37.25 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  35.92 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  37.63 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1087  IS66 Orf2 like protein  34.62 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  36.89 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  32.65 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0258  hypothetical protein  36.79 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0620314 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4398  IS66 Orf2 family protein  36.46 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201394  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3197  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3699  hypothetical protein  36.46 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.603868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  38.71 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  36.46 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  38.71 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  35.92 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2590  putative transposase, TnpB  35.85 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  35.92 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  34.95 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>