23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6032 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6032  toxin of a toxin/antitoxin system  100 
 
 		 123 aa  246  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0329  PilT protein-like  59.35 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3046  PilT protein-like  56.1 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454539  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5320  PilT domain-containing protein  56.1 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4948  PilT domain-containing protein  55.28 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651261  decreased coverage  0.006546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0610  PilT protein-like protein  53.39 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3923  PilT domain-containing protein  52.14 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.547564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1578  PIN domain protein  52.17 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0229  PilT protein domain protein  51.3 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0701  nucleic acid-binding protein  46.96 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1289  PilT protein domain protein  50.43 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.745821  unclonable  0.0000000000204533 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5123  PilT protein domain protein  47.37 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.971488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11136  hypothetical protein  50.88 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4802  PilT domain-containing protein  48.65 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.005118  normal  0.0206517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0411  PilT domain-containing protein  45.22 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0630  PilT domain-containing protein  47.37 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5817  hypothetical protein  44.74 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3863  PilT domain-containing protein  46.43 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.418671  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0073  PilT domain-containing protein  44.83 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4800  PilT protein-like  41.75 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46630  PIN-domain protein  43.75 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0697  PilT protein-like protein  41.03 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.305282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5803  hypothetical protein  39.68 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>