13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5983 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5983  cation efflux system protein CzcI  100 
 
 		 115 aa  242  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000294798  normal  0.0645657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1846  hypothetical protein  40.16 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.305228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1333  hypothetical protein  39.02 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545088  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3971  hypothetical protein  35.94 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2099  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2386  hypothetical protein  41.67 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000211646  normal  0.0960763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2621  hypothetical protein  35.29 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770094  normal  0.544894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18530  hypothetical protein  33.88 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120945  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4595  obalt-zinc-cadmium resistance regulatory protein  39.06 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152895  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3558  hypothetical protein  51.32 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2670  hypothetical protein  34.4 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0464147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1090  hypothetical protein  30.08 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2569  hypothetical protein  62.07 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>