35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6034 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  58.72 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  56.6 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  55.32 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  55.56 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  55.56 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  52.84 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  41.92 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  40.67 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  40.38 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  36.86 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  36.68 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  37.91 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  35.38 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  37.74 
 
 		 275 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  37.26 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  35.41 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  35.27 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  34.6 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  28.7 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  29.15 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  25.19 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  27.23 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  26.97 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  27.8 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  27.51 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  26.48 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  41.43 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  24.89 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  25.29 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  24.21 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  25.37 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  27.05 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  26.14 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3620  hypothetical protein  37.68 
 
 		 97 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.567327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>