10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5955 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5955    100 
 
 		 105 bp  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0207427 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6456  phage integrase  87.21 
 
 		 1692 bp  83.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5389  integrase family protein  91.49 
 
 		 1728 bp  61.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.028287  normal  0.0149159 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5291  phage integrase  87.27 
 
 		 1698 bp  54  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5567  phage integrase family protein  87.27 
 
 		 1698 bp  54  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1882  phage integrase family protein  86.79 
 
 		 1701 bp  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.496854  normal  0.778139 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1438  phage integrase  82.5 
 
 		 1737 bp  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6390  phage integrase family protein  82.5 
 
 		 1737 bp  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.82741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1337  phage integrase family protein  96.15 
 
 		 1698 bp  44.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515892  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4810    89.47 
 
 		 348 bp  44.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>