181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lppt15 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 88 bp  99.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  93.7  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  89.02 
 
 		 88 bp  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  89.89 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  87.95 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  87.78 
 
 		 126 bp  75.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0046  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  97.56 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1653  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  69.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0015  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00194399  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  84.09 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2241  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2328  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0176305  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0023  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220081 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0067  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.978703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0050  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0056  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1542  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6026  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1785  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1758  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1981  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0100  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.170842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t09173  tRNA-Ser  83.53 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.694457  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0062  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0040  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0721486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0105  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0580188  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0018  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0068  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000566911  normal  0.0203429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0094  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000282706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0085  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0945939  normal  0.0146717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0096  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.127387  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0097  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159037  normal  0.0335042 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0045  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0053  tRNA-Ser  86.49 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.163245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0036  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122746 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0051  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0333469  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0017  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576804  normal  0.691356 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0072  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0637954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0065  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0043  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0965121  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0009  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0007  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0042  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000308763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012386 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0886  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t51  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00175911  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0066  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.758388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0092  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.742735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0118  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00112512  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0002  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00386906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0056  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00413677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0993  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000644963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0023  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0033  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>