17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0036 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0009  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0059  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.686612  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0053  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0067  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.978703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0059  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0046  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01840  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>