15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0009 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 82 bp  163  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483868  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0053  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 82 bp  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0036  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0052  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  94.87 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0059  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.686612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0021  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.283628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0042  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0067  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.978703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>