74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2328 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2328  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0176305  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2241  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1653  tRNA-Ser  94.57 
 
 		 90 bp  137  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1785  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1758  tRNA-Ser  92.22 
 
 		 88 bp  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1981  tRNA-Ser  92.22 
 
 		 88 bp  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  92.22 
 
 		 88 bp  107  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1542  tRNA-Ser  91.95 
 
 		 85 bp  101  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  88.75 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  97.44 
 
 		 88 bp  69.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0054  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0731881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2705  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.296774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2353  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2352  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.488752  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  84.51 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  84.51 
 
 		 126 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0014  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  84.51 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3157t  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3159t  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1106t  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1109t  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.060013  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1111t  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.797073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1123t  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0072  tRNA-Ser  87.04 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0637954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0065  tRNA-Ser  87.04 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0001  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0003  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000308763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0056  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0050  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0001  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0045  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.331692  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t09173  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.694457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0046  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna016  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000103361  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna009  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna117  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna043  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06826  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05459  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03029  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00325  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2548  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221952  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1628  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  90 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0006  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.121639  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0005  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.179049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0051  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0333469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>