248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0101 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  98.89 
 
 
90 bp  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0006  tRNA-Ser  95.56 
 
 
90 bp  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.121639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  94.51 
 
 
91 bp  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  90.11 
 
 
91 bp  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0009  tRNA-Ser  86.67 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0004  tRNA-Ser  90.32 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  86.67 
 
 
89 bp  75.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0026  tRNA-Ser  89.06 
 
 
90 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  93.62 
 
 
86 bp  69.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.44549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_513  tRNA-Ser  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0002  tRNA-Ser  84.78 
 
 
92 bp  65.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000138039  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  89.06 
 
 
88 bp  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  97.22 
 
 
85 bp  63.9  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0003  tRNA-Ser  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000308763  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0001  tRNA-Ser  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0001  tRNA-Ser  94.87 
 
 
86 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt03  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.038347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  60  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179868  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  83.72 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  60  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1368  tRNA-Ser  92.86 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0526  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  60  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0045  tRNA-Ser  91.3 
 
 
93 bp  60  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.331692  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  83.33 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.8 
 
 
86 bp  58  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  89.8 
 
 
86 bp  58  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  91.11 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  56  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.507885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309348  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA21  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213698  normal  0.11304 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0057  tRNA-Ser  90.7 
 
 
90 bp  54  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0026    94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0760613  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  84.62 
 
 
90 bp  54  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0019  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0002  tRNA-Ser  96.77 
 
 
85 bp  54  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0057  tRNA-Ser  90.7 
 
 
90 bp  54  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0056  tRNA-Ser  90.7 
 
 
90 bp  54  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0003  tRNA-Ser  96.77 
 
 
89 bp  54  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0018  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0022  tRNA-Ser  94.29 
 
 
90 bp  54  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  94.29 
 
 
88 bp  54  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  94.29 
 
 
91 bp  54  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0015  tRNA-Ser  96.77 
 
 
90 bp  54  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399883  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0004  tRNA-Ser  90.7 
 
 
96 bp  54  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489896  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0055  tRNA-Ser  90.7 
 
 
90 bp  54  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0709169  normal  0.617884 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309077  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309109  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.701033  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  94.29 
 
 
91 bp  54  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309153  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0049  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430745  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  96.67 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  96.67 
 
 
88 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  96.67 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  89.13 
 
 
86 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0014  tRNA-Ser  96.67 
 
 
91 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0063  tRNA-Ser  96.67 
 
 
93 bp  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.80963  normal  0.240218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0055  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.983952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  96.67 
 
 
88 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0046  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.557666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 
88 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0042  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0071  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612949  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  85.48 
 
 
90 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  96.67 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0050  tRNA-Ser  96.67 
 
 
95 bp  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  96.67 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0039  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  96.67 
 
 
88 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0044  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0050  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0567726  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0020  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474391  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  96.67 
 
 
88 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0015  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00859623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  96.67 
 
 
91 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0020  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000279597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>