84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_R0005 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.179049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  90.28 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.232156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0015  tRNA-Ser  91.07 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00859623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0038  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00055942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0045  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 93 bp  67.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.331692  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  84.52 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  92.73 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  90.16 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0005  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.87296e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0057  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0057  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0056  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0055  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0709169  normal  0.617884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0003  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000261436  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0056  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0003  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0058  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0058  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 86 bp  54  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.337917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0077  tRNA-Ser  87.04 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.361523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0008  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909337  hitchhiker  0.00840657 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0001  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0040  tRNA-Ser  84.29 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0040  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0721486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0026  tRNA-Ser  87.76 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0014  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  86.79 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0072  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0637954 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0065  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0003  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000308763  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0056  tRNA-Ser  86.27 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0001  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  89.74 
 
 		 126 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pseudo-1  tRNA-OTHER  90.2 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.526537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2328  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0176305  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2241  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1653  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0001  tRNA-Ser  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012386 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1542  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03440  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0046  tRNA-Tyr  100 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0576643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0037  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.244587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0037  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.315866  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0022  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000743808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1785  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1758  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0006  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.121639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0021  tRNA-Ser  82.86 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.846979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0004  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489896  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.35196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1981  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0029  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0007  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000441599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0043  tRNA-Ser  82.86 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0583145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000268817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.265922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0033  tRNA-Ser  88.1 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>