45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0054 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0731881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0004  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 88 bp  75.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558819  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03630  tRNA-Ser  89.86 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0004  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2328  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0176305  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2241  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1653  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0051  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0333469  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0039  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0116  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1542  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1758  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1785  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1981  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0601  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000039109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5672  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000600892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00887784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000630306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0525  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48136e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4776  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022881  hitchhiker  0.0000000000000230511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5707  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000958315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0078  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000549409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0075  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1123t  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1111t  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.797073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1109t  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.060013  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1106t  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3159t  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3157t  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0004  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 96 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.489896  normal  0.220427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer01  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.454319  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0024  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  89.47 
 
 		 126 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>