22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03630 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_03630  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0014  tRNA-Ser  90.28 
 
 
91 bp  87.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0013  tRNA-Ser  90.28 
 
 
91 bp  87.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  92.31 
 
 
91 bp  71.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0004  tRNA-Ser  87.88 
 
 
91 bp  67.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231832  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0054  tRNA-Ser  89.86 
 
 
93 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0731881 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0004  tRNA-Ser  86.96 
 
 
88 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558819  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  86.36 
 
 
88 bp  60  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1368  tRNA-Ser  90.7 
 
 
88 bp  54  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000356582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000020571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  83.56 
 
 
91 bp  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0006  tRNA-Ser  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.121639  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07010  tRNA-Ser  82.14 
 
 
88 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0066  tRNA-Ser  93.75 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.332689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0101  tRNA-Ser  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174048  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0058  tRNA-Ser  91.67 
 
 
91 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481148  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  91.67 
 
 
90 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0024  tRNA-Ser  96.3 
 
 
90 bp  46.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.107228  normal  0.17939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  96.15 
 
 
91 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0017  tRNA-Ser  96.15 
 
 
90 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00284743  normal  0.30406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>