105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ser-6 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000600892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00887784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000630306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0601  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000039109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5707  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000958315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4776  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022881  hitchhiker  0.0000000000000230511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0525  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48136e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5672  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0078  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000549409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0075  tRNA-Ser  98.91 
 
 		 92 bp  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0039  tRNA-Ser  90.22 
 
 		 91 bp  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0116  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  95.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 89 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0031  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.183154  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27990  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0003  tRNA-Ser  88.04 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000641066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0037  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 93 bp  85.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0029  tRNA-Ser  86.52 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000379468  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0029  tRNA-Ser  86.52 
 
 		 89 bp  81.8  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000406905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11590  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0287  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000949487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0073  tRNA-Ser  84.78 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0003  tRNA-Ser  84.78 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0650354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0036  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.5837599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0007  tRNA-Ser  86.05 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0166763  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0076  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  86.57 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0043  tRNA-Ser  87.32 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00175988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0048  tRNA-Ser  87.32 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0051  tRNA-Ser  87.32 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0057  tRNA-Ser  87.32 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0060  tRNA-Ser  84.27 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.472015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 88 bp  56  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0024  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0025  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112044  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0023  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0167  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1831  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  84.21 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  83.7 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  83.7 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0040  tRNA-Ser  84.51 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  84.51 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  84.51 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0026  tRNA-Ser  85.39 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0020  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000608606  hitchhiker  0.0000000136932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0017  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0022  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.155688  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0007  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 94 bp  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.12584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0002  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0054  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0731881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0040  tRNA-Ser  86.3 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0044  tRNA-Ser  86.3 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0051  tRNA-Ser  86.3 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0055  tRNA-Ser  86.3 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0002  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000353165 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0022  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0453  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  85.94 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0010  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0010  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.710813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  46.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t30  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0051  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.814887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0055  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.265922  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0053  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000556956  hitchhiker  0.00693696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0082  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338045  normal  0.030593 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0075  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781608  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0009  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000326555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0040  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.851223  normal  0.588712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0022  tRNA-Ser  85.14 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>