295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0022 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0022  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.155688  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0025  tRNA-Ser  93.1 
 
 		 94 bp  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04528  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 94 bp  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0104134  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0016  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 94 bp  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.59957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0013  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 94 bp  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0131326  normal  0.0455197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0014  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 94 bp  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010946  hitchhiker  0.00318065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0029  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112304  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0114539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0066  tRNA-Ser  89.66 
 
 		 93 bp  93.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00121253  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0009  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00103518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2675  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0027  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614719  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2153  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1426  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2590  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1946  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0046  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960989  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0027  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113277  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3162  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635575  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0091  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2538  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0059  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00785385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0051  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0325227  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0059  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.233723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0059  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0057  tRNA-Ser  88.51 
 
 		 94 bp  93.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0067  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198347  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  88.42 
 
 		 94 bp  85.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0007  tRNA-Ser  88.42 
 
 		 94 bp  85.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.12584  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0075  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0035  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0027  tRNA-Ser  91.07 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 96 bp  69.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0002  tRNA-Ser  97.44 
 
 		 93 bp  69.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0002  tRNA-Ser  97.44 
 
 		 93 bp  69.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000353165 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  85.11 
 
 		 92 bp  69.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0005  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 95 bp  69.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1044  tRNA-Ser  86.17 
 
 		 92 bp  67.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 96 bp  67.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0062  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0004  tRNA-Ser  85.26 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0048  tRNA-Ser  85.26 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000235294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0057  tRNA-Ser  85.26 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.328322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  85.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0058  tRNA-Ser  85.26 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.325073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0054  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000333632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0038  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0435402  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0111  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000122567  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0090  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00126509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0096  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000162455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0105  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000566393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0102  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0048  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000880643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0057  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000281026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0897  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0054  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000379646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0096  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000137453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  0.0000655456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0106  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4271  tRNA-Ser  85.06 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  9.700030000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0010  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0010  tRNA-Ser  90 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.710813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t07  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506644  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t24  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313703  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0058  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt18  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt19  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA56  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00168094  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0026  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.548362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R71  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000974283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.489158 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0057  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0633  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0448  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.359663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0011  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0060178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0051  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0033  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.172474  normal  0.681526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>