32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0027 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0022  tRNA-Ser  91.07 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.155688  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_003295  RS04528  tRNA-Ser  85.37 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0104134  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0016  tRNA-Ser  85.37 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.59957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0013  tRNA-Ser  85.37 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0131326  normal  0.0455197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0014  tRNA-Ser  85.37 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010946  hitchhiker  0.00318065 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0018  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0238889  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0114539  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0029  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112304  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0051  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0325227  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0059  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.233723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0059  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00785385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0027  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113277  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1426  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2590  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2538  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3162  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2153  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0057  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0059  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102937  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0091  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0046  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960989  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1946  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2675  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0009  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00103518  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0067  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198347  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0025  tRNA-Ser  85.94 
 
 		 94 bp  56  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0066  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00121253  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0055  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267129  decreased coverage  0.00667761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0053  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0006  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000515355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0020  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.190348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>