119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0037 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0037  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5672  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 92 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 95 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000600892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 95 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00887784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 95 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000630306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 92 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0075  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 92 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0078  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 92 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000549409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0601  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 94 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000039109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5707  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 94 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000958315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4776  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 94 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022881  hitchhiker  0.0000000000000230511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0525  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 94 bp  85.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48136e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0039  tRNA-Ser  97.83 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0116  tRNA-Ser  97.83 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0003  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 91 bp  67.9  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000641066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11590  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 92 bp  63.9  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0453  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  90 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27990  tRNA-Ser  92 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0036  tRNA-Ser  90.57 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.5837599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 93 bp  56  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0073  tRNA-Ser  90.38 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0031  tRNA-Ser  90.38 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.183154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27190  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000521392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0042  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.121503  normal  0.0171671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0046  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60240  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268246  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  88 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0012  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.250098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.510614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0060  tRNA-Ser  87.76 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.472015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0040  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0033  tRNA-Ser  90 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer03  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.666732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0287  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000949487  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0026  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 88 bp  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0055  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0051  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0044  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0040  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00022  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.183053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00024  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0051  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000257936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0053  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t30  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0532  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.936136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0073  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0064  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.019452  normal  0.0125839 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0043  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027845  normal  0.0982553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1356  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00596474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0082  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.338045  normal  0.030593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01622  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4662  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0024856  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4664  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.016683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5025  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000128113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5027  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0040  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.851223  normal  0.588712 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0064  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.138222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0066  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2101  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.995337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2238  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0022  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2774  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2776  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00819778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0001  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0983  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1229  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1049  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0942593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1244  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.423353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1064  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1199  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.754865 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0955  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.220816  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2057  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1015  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2240  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.247872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1045  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00618881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>