290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0046 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0039  tRNA-Ser  98 
 
 		 91 bp  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0116  tRNA-Ser  98 
 
 		 91 bp  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0003  tRNA-Ser  96 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000641066  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 88 bp  81.8  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0054  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00119077  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11590  tRNA-Ser  97.87 
 
 		 92 bp  77.8  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0037  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0042  tRNA-Ser  91.38 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27990  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 92 bp  69.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.510614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00121332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5672  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000600892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00887784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000630306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0075  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0525  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48136e-28 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0078  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000549409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.025626  hitchhiker  0.00000743472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4776  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022881  hitchhiker  0.0000000000000230511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5707  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000958315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0601  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000039109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  85.37 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0073  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0031  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.183154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0097  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.368592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.106219  normal  0.177899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 94 bp  58  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  91.11 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  58  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  hitchhiker  0.00000112362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000844947  hitchhiker  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  83.87 
 
 		 93 bp  58  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000565734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4314  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.650713  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0006  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000515355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0060  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.472015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0025  tRNA-Ser  84.15 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0056  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0034  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0134  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.756856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0036  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.5837599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0004  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.303536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0004  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.020254  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4577  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0003  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0650354 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  82.61 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0018  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0034  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562002  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0071  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612949  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0020  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>