196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_R0013 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_R0013  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0020  tRNA-Ser  90.28 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.178349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0023  tRNA-Ser  90.28 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0027  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 90 bp  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0072  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.789725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0062  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2408  normal  0.378741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0085  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0060  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0065  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0061  tRNA-Ser  86.11 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.388434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0020  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000279597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna26  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540451  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0002  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna25  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000226123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0061  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309197  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.159743  normal  0.113678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0020  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0056  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00413677  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  83.91 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  60  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.368592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.874124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0009  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.106219  normal  0.177899 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0003  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  hitchhiker  0.00000112362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0037  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0030  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.849468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.5837599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0815  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0378889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0078  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0030  tRNA-Ser  84.72 
 
 		 90 bp  56  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0016  tRNA-Ser  82.76 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.116346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000844947  hitchhiker  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  54  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000565734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0046  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0097  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0024  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00121332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000860706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28090  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.025626  hitchhiker  0.00000743472 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0010  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0026  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.580647  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00119077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0027  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0037  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0035  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0014  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0936822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0045  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.331692  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0019  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0015  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00859623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0011  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000281552  normal  0.938437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0002  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0034  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0467968  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0024  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.595817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0023  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0042  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2302  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0031267  hitchhiker  2.33425e-18 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0165  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0050  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0567726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0020  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0294133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0042  tRNA-Ser  82.95 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0071  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612949  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0004  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0020  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0021  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 90 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.846979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>