93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11590 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_11590  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27990  tRNA-Ser  96.74 
 
 		 92 bp  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0003  tRNA-Ser  90.22 
 
 		 92 bp  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0650354 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12720  tRNA-Ser  97.92 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.376956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0525  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 94 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48136e-28 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4776  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 94 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022881  hitchhiker  0.0000000000000230511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5707  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 94 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000958315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0601  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 94 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000039109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27540  tRNA-Ser  95.83 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00531398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 95 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000630306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 95 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00887784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 95 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000600892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5672  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0078  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000549409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0075  tRNA-Ser  85.87 
 
 		 92 bp  79.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  97.87 
 
 		 92 bp  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0060  tRNA-Ser  88.61 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.472015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0031  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.183154  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0073  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 92 bp  75.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0008  tRNA-Ser  95.35 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0039  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0116  tRNA-Ser  95.74 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 92 bp  67.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  95.65 
 
 		 88 bp  67.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0037  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0004  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0003  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000641066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  93.48 
 
 		 88 bp  60  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0036  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 86 bp  60  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.5837599999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  85.11 
 
 		 94 bp  60  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  84.04 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0048  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214676 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.510614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0009  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000326555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  85.11 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0076  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0287  tRNA-Ser  84.93 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000949487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0059  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000963378  hitchhiker  0.00000000000285313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0016  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0029  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467256 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0167  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0023  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0062  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  82.61 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0033  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0030  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00350968  decreased coverage  0.0000118989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0034  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03460  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0062  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0062  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1831  tRNA-Ser  89.58 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.399609  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0024  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0060  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4609  tRNA-Ser  90 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  84.13 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0029  tRNA-Ser  82.28 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000379468  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0036  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688413  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0029  tRNA-Ser  82.28 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000406905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0056  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t51  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00175911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA25  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0856542  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0076  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R24  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.902283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0018  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0075  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  89.13 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>