38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0076 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0076  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5672  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0525  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48136e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4776  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022881  hitchhiker  0.0000000000000230511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5707  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000958315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0601  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000039109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0078  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000549409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0075  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000600892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00887784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 95 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000630306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27990  tRNA-Ser  90 
 
 		 92 bp  60  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0017  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0015  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0031  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.183154  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0453  tRNA-Ser  90.57 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0020  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000608606  hitchhiker  0.0000000136932 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0029  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000379468  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0029  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000406905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0063  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0003  tRNA-Ser  92.68 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000641066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11590  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0116  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0039  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.656743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159641  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0022  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0052  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.495975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0036  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0016  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.367308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0010  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.870532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0060  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.472015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0048  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00175988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0022  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.155688  normal  0.486263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>