25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ser-2 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0039  tRNA-Ser  94.32 
 
 		 88 bp  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0569  tRNA-Ser  96 
 
 		 88 bp  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  87.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0002  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 92 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0091  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0055  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0084  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.242329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0043  tRNA-Ser  90.2 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000118785  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0052  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.495975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0036  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.367308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.870532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0001  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0051  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000993594  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1213  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.645556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0017  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0076  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>