21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_t1213 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_t1213  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.645556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1567  tRNA-Ser  95.51 
 
 		 90 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1602  tRNA-Ser  95.51 
 
 		 90 bp  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0001  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  93.7  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533171  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1914  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0011  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 92 bp  69.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0017  tRNA-Ser  90.38 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  90.38 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  90.38 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  90.38 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0042  tRNA-Ser  95 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0026  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0025  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  92.11 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  90 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0039  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0569  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>