49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0001 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0001  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0042  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 88 bp  95.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1213  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  93.7  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.645556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0025  tRNA-Ser  88.76 
 
 		 89 bp  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0026  tRNA-Ser  92.19 
 
 		 89 bp  87.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0025  tRNA-Ser  92.19 
 
 		 89 bp  87.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  88.46 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  88.46 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  90.62 
 
 		 89 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1602  tRNA-Ser  97.73 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1567  tRNA-Ser  97.73 
 
 		 90 bp  79.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0017  tRNA-Ser  92.16 
 
 		 91 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  92.16 
 
 		 91 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  92.16 
 
 		 91 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  92.16 
 
 		 91 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1914  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 94 bp  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0011  tRNA-Ser  92.16 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0043  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  60  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5664  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 93 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000954474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5052  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 93 bp  60  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5657  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0292  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000690244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4983  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0270  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0232  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00209644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5799  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5014  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0123  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5712  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.449499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000833602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.104263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000756645  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0039  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0018  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0238889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>