103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ser-7 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000756645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5014  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5799  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0232  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00209644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4983  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5657  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5712  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.449499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000833602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.104263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0123  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0292  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000690244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0270  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0043  tRNA-Ser  98.9 
 
 		 91 bp  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5664  tRNA-Ser  98.9 
 
 		 93 bp  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000954474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5052  tRNA-Ser  98.9 
 
 		 93 bp  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  95.6 
 
 		 91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  95.6 
 
 		 91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0042  tRNA-Ser  90.59 
 
 		 88 bp  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0025  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0026  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 89 bp  71.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 89 bp  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0017  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0010  tRNA-Ser  87.14 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1914  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0025  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0045  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0001  tRNA-Ser  83.33 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna9  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0047  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00947013  normal  0.245138 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.183333  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0002  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.320544  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t07  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.506644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0026  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0633  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248026  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0051  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0002  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00050  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000206027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0020  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.35698e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0039  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174136  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151181 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0203  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.829329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0060178  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer02  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0448  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.359663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0074  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000641426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0076  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000654825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0078  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000727042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4271  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  9.700030000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0993  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000644963  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03505  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03508  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4692  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.17965e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5063  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000188963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0031  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000107168  unclonable  0.00000000962394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6023  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0886  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0897  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000417881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0054  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000000379646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0024  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000116075  hitchhiker  0.00382686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2817  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020425  hitchhiker  0.000210656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3291  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.24422e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3027  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000838388  decreased coverage  0.00000641147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3011  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  hitchhiker  0.0000219403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2976  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000227205  decreased coverage  0.0000509713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2944  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3134  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000254951  hitchhiker  0.00502595 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3128t  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3130t  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3941  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307752  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0656  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0134  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.756856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000118785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0084  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.242329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0021  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.724963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0027  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000624593  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0072  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00236568  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0166763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0055  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0091  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0025  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00144133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>