140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0023 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0042  tRNA-Ser  87.91 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0017  tRNA-Ser  97.87 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  97.87 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  97.87 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  97.87 
 
 		 91 bp  85.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0270  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5799  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5657  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 91 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5712  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 91 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.449499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5664  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000954474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000833602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000756645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5052  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 91 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 91 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.104263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4983  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0232  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00209644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0043  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 91 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0123  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 91 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5014  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0292  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000690244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0001  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533171  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1567  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1602  tRNA-Ser  95 
 
 		 90 bp  63.9  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1914  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0011  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  91.3 
 
 		 91 bp  60  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0238889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0025  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 89 bp  56  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0025  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0026  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna9  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0047  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00947013  normal  0.245138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t084  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t090  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0042  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000792728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000142522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0049  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000282544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.11971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494223  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0038  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000174054  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000325542  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0045  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 90 bp  50.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0096  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000137453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0102  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0031  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000309112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0090  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00126509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0096  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000162455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0105  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000566393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0111  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000122567  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000880643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0054  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000333632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0057  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000281026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0007  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000625255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1213  tRNA-Ser  90 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.645556  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0058  tRNA-Ser  82.72 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0007  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0117115  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0039  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174136  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0203  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.829329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0020  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.417129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer02  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0074  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000641426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0076  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000654825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0078  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000727042  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0035  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.168355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3291  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.24422e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3027  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000838388  decreased coverage  0.00000641147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3011  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  hitchhiker  0.0000219403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2976  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000227205  decreased coverage  0.0000509713 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2944  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000934837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>