56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0011 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1602  tRNA-Ser  92.65 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1567  tRNA-Ser  92.65 
 
 		 90 bp  87.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0042  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0002  tRNA-Ser  88.3 
 
 		 94 bp  83.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000920223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  93.88 
 
 		 94 bp  73.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0026  tRNA-Ser  90.62 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0025  tRNA-Ser  90.62 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1213  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 93 bp  69.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.645556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  92.45 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  92.45 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  92.45 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0017  tRNA-Ser  92.45 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0001  tRNA-Ser  92.16 
 
 		 88 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  93.62 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.36 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1914  tRNA-Ser  91.49 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0096  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000162455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0096  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000137453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0090  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00126509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0105  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000566393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0111  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000122567  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000880643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0054  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000333632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0057  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000281026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t084  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t090  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0042  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000792728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000142522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0049  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000282544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.11971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494223  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0038  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000174054  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000325542  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0102  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0031  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000309112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0316  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00631061  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0569  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0009  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178185  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0035  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.168355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>