104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_R0025 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  98.88 
 
 		 89 bp  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0042  tRNA-Ser  94.74 
 
 		 88 bp  111  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0001  tRNA-Ser  92.19 
 
 		 88 bp  87.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  90.48 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1567  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1602  tRNA-Ser  97.78 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0011  tRNA-Ser  90.62 
 
 		 92 bp  73.8  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5657  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5712  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.449499  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000833602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000756645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 94 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.104263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0123  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0292  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 93 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000690244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5014  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 93 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5799  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 93 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0232  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 93 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00209644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0270  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 93 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4983  tRNA-Ser  89.06 
 
 		 93 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0043  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5664  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000954474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5052  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 93 bp  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1213  tRNA-Ser  97.14 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.645556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0017  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0569  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1914  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.924636  hitchhiker  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.626616  normal  0.0403391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.690365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0029  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0662946  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  92.86 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0025  tRNA-Ser  86.15 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  86.44 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  86.44 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0008  tRNA-Ser  86.44 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0009  tRNA-Ser  86.44 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.509163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0021  tRNA-Ser  84.75 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_003295  RS04528  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0104134  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0114539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0066  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00121253  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00103518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0025  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2675  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0067  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198347  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1946  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0057  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0597346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0039  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0368673  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0046  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960989  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0537085  normal  0.0209317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0014  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010946  hitchhiker  0.00318065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0018  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  0.166576 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0091  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0059  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0057  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2153  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3162  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635575  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2538  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2590  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1426  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA23  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658425  normal  0.252168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0268608  normal  0.036349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0046  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.574265  normal  0.350655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0027  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113277  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0018  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0049  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0059  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00785385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.841782  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0059  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.233723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0030  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0051  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0325227  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0009  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0029  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112304  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0013  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0131326  normal  0.0455197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0006  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0023  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0058  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0027  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614719  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0058  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0013  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>