44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0025 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000106194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0001  tRNA-Ser  88.76 
 
 		 88 bp  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  88.61 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  88.61 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5052  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5664  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 93 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000954474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0043  tRNA-Ser  86.08 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  83.52 
 
 		 94 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5712  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.449499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4983  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0270  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0232  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00209644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5799  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5014  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0292  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000690244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0123  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.873208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5657  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000833602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000756645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.104263  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  84.81 
 
 		 94 bp  54  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0017  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0020  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0017  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0020  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 91 bp  54  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna9  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0047  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00947013  normal  0.245138 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0026  tRNA-Ser  86.15 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019004  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0025  tRNA-Ser  86.15 
 
 		 89 bp  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260292  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1567  tRNA-Ser  85.07 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1602  tRNA-Ser  85.07 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0018  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0238889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 96 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 95 bp  44.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>