177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_R0063 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  97.14 
 
 
93 bp  61.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  97.14 
 
 
90 bp  61.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  60  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  60  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  96.97 
 
 
94 bp  58  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 
96 bp  58  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0048  tRNA-Ser  96.97 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0798542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0047  tRNA-Ser  96.97 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0031  tRNA-Ser  96.97 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.981637  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  96.97 
 
 
89 bp  58  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  96.97 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0036  tRNA-Ser  96.97 
 
 
93 bp  58  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0051  tRNA-Ser  96.97 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000406758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  96.88 
 
 
94 bp  56  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t15  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  96.88 
 
 
93 bp  56  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0038  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00055942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  96.88 
 
 
88 bp  56  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  96.88 
 
 
90 bp  56  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  96.88 
 
 
91 bp  56  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  96.77 
 
 
90 bp  54  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  96.67 
 
 
91 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.417129  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0027  tRNA-Ser  100 
 
 
85 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000116718  hitchhiker  6.42112e-17 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0011  tRNA-Ser  96.67 
 
 
93 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  96.67 
 
 
126 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  96.67 
 
 
90 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.55 
 
 
93 bp  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0043  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0613926  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0058  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154227  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  96.55 
 
 
96 bp  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t17  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0009  tRNA-Ser  96.55 
 
 
93 bp  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 
90 bp  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  96.55 
 
 
88 bp  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  96.55 
 
 
90 bp  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0046  tRNA-Ser  93.94 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000102929  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0024  tRNA-Ser  96.55 
 
 
90 bp  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.107228  normal  0.17939 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  96.55 
 
 
94 bp  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  96.55 
 
 
96 bp  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0066  tRNA-Ser  96.55 
 
 
87 bp  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  96.55 
 
 
90 bp  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0033  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.985807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0062  tRNA-Ser  96.55 
 
 
95 bp  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 
96 bp  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0038  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0038  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231561  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  96.55 
 
 
91 bp  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0054  tRNA-Ser  96.55 
 
 
94 bp  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0038  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0435402  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0018  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0238889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  0.0000655456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0106  tRNA-Ser  96.55 
 
 
92 bp  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  96.55 
 
 
95 bp  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.75 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  93.75 
 
 
91 bp  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  93.75 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0022  tRNA-Ser  93.75 
 
 
92 bp  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  93.75 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0010  tRNA-Ser  93.75 
 
 
93 bp  48.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0597346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0037  tRNA-Ser  96.43 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.244587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0001  tRNA-Ser  93.75 
 
 
91 bp  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  93.75 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0018  tRNA-Ser  93.75 
 
 
93 bp  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  0.166576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  93.75 
 
 
91 bp  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tSer02  tRNA-Ser  96.43 
 
 
92 bp  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.111902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  96.43 
 
 
95 bp  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0046  tRNA-Ser  93.75 
 
 
94 bp  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.506638  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0053  tRNA-Ser  93.75 
 
 
93 bp  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0350418  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  93.75 
 
 
91 bp  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  93.75 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0054  tRNA-Ser  93.75 
 
 
93 bp  48.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000329774  hitchhiker  1.7085e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0037  tRNA-Ser  93.75 
 
 
94 bp  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  93.75 
 
 
91 bp  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  93.75 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0056  tRNA-Ser  93.75 
 
 
93 bp  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0268608  normal  0.036349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  93.75 
 
 
90 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0041  tRNA-Ser  96.43 
 
 
88 bp  48.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000391887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0005  tRNA-Ser  93.75 
 
 
94 bp  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0203622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>