16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0051 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0051  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000993594  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.609498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0020  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0034  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0087  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0124  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.386315  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0569  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0039  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0089  tRNA-Ser  84.13 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0098  tRNA-Ser  84.13 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0102  tRNA-Ser  84.13 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>