111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0102 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0102  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0089  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0098  tRNA-Ser  95.51 
 
 		 90 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0006  tRNA-Ser  89.25 
 
 		 93 bp  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0075  tRNA-Ser  89.25 
 
 		 93 bp  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0265874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0003  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0982572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0003  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0051  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0051  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0085  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 91 bp  83.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0049  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0049  tRNA-Ser  86.02 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 86 bp  58  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  86.84 
 
 		 96 bp  56  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  86.84 
 
 		 96 bp  56  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0103  tRNA-Ser  86.84 
 
 		 93 bp  56  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0019084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5642  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000000296932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 96 bp  54  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00996229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0006  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000423929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0104  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0128  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000982441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0006  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00626925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0019  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000851683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5621  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000119043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5301  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000200966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0017  tRNA-Ser  92.31 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000551383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27960  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.251504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11580  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00471501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  82.02 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.609498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  82.02 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  82.02 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0054  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.6985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0020  tRNA-Ser  82.02 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0530  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.159007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0034  tRNA-Ser  82.02 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0007  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000441599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t17  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0033  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.985807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0038  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0038  tRNA-Ser  88.64 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231561  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0051  tRNA-Ser  84.13 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000993594  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0570  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0008  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.443501 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t28  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t090  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt020  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000431607  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0052  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0014  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0745  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0014  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0710717  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000792728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0049  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000282544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494223  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0001  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00401168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1219  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.27897  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0032  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0176  tRNA-Ser  89.47 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0041  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0047  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000174054  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000325542  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1025  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0262205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0096  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000137453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0102  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0026  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0031  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000309112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0090  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00126509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0096  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000162455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0105  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000566393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0111  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000122567  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0027  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000880643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0054  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000333632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0114  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000117562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0120  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0003  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 89 bp  44.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>