169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0570 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0570  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  188  2e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0075  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 93 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0265874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0006  tRNA-Ser  89.53 
 
 		 93 bp  99.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 96 bp  97.6  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 96 bp  97.6  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0132  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0436825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0107  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5621  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000119043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5642  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000000296932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5697  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000298062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5698  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000355896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5721  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00773154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0006  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00626925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0019  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000851683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00996229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00153665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000141022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.810758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000110758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00215881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00820764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000171949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4568  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000817931  normal  0.113574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0223  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000840051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5023  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000182433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0108  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00019305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000960396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4992  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0128  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000982441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5735  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0864  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000094227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5808  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00229715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5301  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000200966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4567  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000086001  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5736  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000117454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0104  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 90 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0789  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7543300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0788  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43365e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0017  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0003  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0982572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0003  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0006  tRNA-Ser  89.61 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000423929  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0051  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0051  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 90 bp  83.8  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0863  tRNA-Ser  88.31 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000999296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0103  tRNA-Ser  88.31 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0019084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0085  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 91 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt020  tRNA-Ser  88 
 
 		 93 bp  77.8  0.0000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000431607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0745  tRNA-Ser  88 
 
 		 93 bp  77.8  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  84.95 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  84.95 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  87.01 
 
 		 96 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  87.01 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000224146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0049  tRNA-Ser  84.95 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0049  tRNA-Ser  84.95 
 
 		 93 bp  73.8  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R16  tRNA-Ser  87.69 
 
 		 91 bp  65.9  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0050  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.609498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0020  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1599  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 91 bp  56  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000303024  normal  0.398385 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0034  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 90 bp  56  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1219  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.27897  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0032  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0176  tRNA-Ser  90.7 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t09173  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.694457  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1071  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0048  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0087  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt19  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00413231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t018  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000138338  hitchhiker  0.0000000303397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0098  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t025  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000628867  hitchhiker  0.000000193085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0089  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0102  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0657  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.96086  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0019  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000041967  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0036  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000164961  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0040  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588297  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0020  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000716898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0042  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000792728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0043  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000142522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0049  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000282544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0041  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0253572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.11971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>