85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP_tRNA-Ser-5 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0051  tRNA-Ser  98.89 
 
 		 90 bp  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0003  tRNA-Ser  98.89 
 
 		 93 bp  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0051  tRNA-Ser  98.89 
 
 		 90 bp  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0003  tRNA-Ser  98.89 
 
 		 93 bp  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0982572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 93 bp  147  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0049  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 93 bp  147  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0049  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 93 bp  147  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  95.56 
 
 		 93 bp  147  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  88.76 
 
 		 96 bp  97.6  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.468376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  88.76 
 
 		 96 bp  97.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0075  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 93 bp  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0265874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0006  tRNA-Ser  87.78 
 
 		 93 bp  91.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0006  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000423929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0223  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000840051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5808  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00229715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5736  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000117454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5735  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5721  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00773154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5698  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000355896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5697  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000298062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5621  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000119043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5642  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000000296932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5023  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000182433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4568  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000817931  normal  0.113574 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0103  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0019084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0104  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 90 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0128  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000982441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0006  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00626925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0107  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0108  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00019305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0132  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0436825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0864  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000094227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0019  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000851683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4567  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000086001  normal  0.0844517 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00996229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00153665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00102171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000141022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.810758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ser-6  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000110758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00215881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00820764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 96 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000171949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4992  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-7  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000960396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0789  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7543300000000004e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0788  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43365e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0017  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5301  tRNA-Ser  87.64 
 
 		 93 bp  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000200966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0863  tRNA-Ser  96 
 
 		 93 bp  83.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000999296  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0570  tRNA-Ser  86.67 
 
 		 95 bp  83.8  0.000000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt020  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  77.8  0.0000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000431607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0745  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  77.8  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0089  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  94 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0102  tRNA-Ser  85.56 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  94 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.609498  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  94 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  94 
 
 		 96 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  94 
 
 		 93 bp  75.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000224146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0020  tRNA-Ser  94 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.111386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1599  tRNA-Ser  94 
 
 		 91 bp  75.8  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000303024  normal  0.398385 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0034  tRNA-Ser  94 
 
 		 90 bp  75.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0098  tRNA-Ser  85.39 
 
 		 90 bp  73.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0087  tRNA-Ser  92 
 
 		 90 bp  67.9  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0176  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0032  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1219  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.27897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0085  tRNA-Ser  84.44 
 
 		 91 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R16  tRNA-Ser  84.62 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0004  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0000142144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0055  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.953649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0055  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 86 bp  44.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t09173  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.694457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0095  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0065  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0046  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0036  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0056  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0050  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0048  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>